Les bactéries intestinales utilisent des armes pour tenir leur terrain
L'intestin est un champ de bataille. Les bactéries s'y dotent de minuscules systèmes d'injection pour éliminer leurs rivales et s'imposer. Une nouvelle étude montre comment cela se déroule dans un écosystème vivant réel.
Dans l'intestin de souris sauvages, une bactérie appelée Bacteroides acidifaciens est dotée d'une arme : le système de sécrétion de type VI (T6SS), un complexe protéique qui permet aux bactéries d'injecter des molécules toxiques directement dans les cellules voisines. Les chercheurs, qui publient dans eLife, montrent que ce système ne fonctionne pas uniquement sur des souches de laboratoire, mais aussi au sein d'un microbiome intestinal complexe, issu de l'évolution naturelle. Les bactéries ayant perdu le T6SS ont progressivement disparu de l'intestin, même lorsqu'elles parvenaient d'abord à s'y maintenir.
Le microbiome intestinal est une communauté de centaines d'espèces bactériennes. La survie ou la disparition de chaque souche dépend de l'alimentation, du système immunitaire et de la compétition entre bactéries. Jusqu'ici, le système de sécrétion de type VI avait été étudié principalement en laboratoire. Cette étude est l'une des premières à montrer qu'il façonne aussi la composition des bactéries intestinales dans un animal vivant.
Une arme transmissible
Fait notable : le gène codant le T6SS se trouve sur un élément génétique mobile, c'est-à-dire un fragment d'ADN capable de passer d'une bactérie à une autre. Les chercheurs ont trouvé des éléments indiquant que cette arme a été échangée récemment entre différentes espèces bactériennes dans l'intestin. La dynamique intestinale est donc plus complexe qu'on ne le pensait : les bactéries partagent non seulement des nutriments et de l'espace, mais aussi des armes.
Lien avec la santé et le vieillissement
Ces résultats intéressent la recherche sur la longévité, car la composition du microbiome intestinal change avec l'âge. Certaines souches augmentent, d'autres disparaissent. Si l'armement bactérien détermine en partie quelles souches persistent, alors le microbiome intestinal vieillissant est en partie façonné par cette compétition microbienne. La manière dont cela influe sur la santé reste une question ouverte, mais ces découvertes apportent un nouveau mécanisme pour mieux comprendre les transformations du microbiome au cours du vieillissement.
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Recherche par exemple :
- type VI secretion system gut microbiome
- interbacterial antagonism Bacteroidales
- mobile genetic element gut bacteria