Les tests microbiome à domicile ont-ils une utilité réelle ?

Les tests microbiome commerciaux promettent souvent un éclairage sur la santé, la maladie, voire le dépistage précoce de certaines pathologies. L'idée est séduisante, mais les données scientifiques disponibles montrent que la recherche est encore loin de pouvoir tenir ces promesses. La biologie sous-jacente est fascinante et fait l'objet de nombreux travaux, mais il n'existe à ce jour aucun test domestique fiable et validé.

Une étude a examiné si un modèle fondé sur sept genres de bactéries intestinales pouvait détecter la polyarthrite rhumatoïde. Le meilleur modèle a atteint une AUC d'environ 71 à 75 %, une mesure de la précision diagnostique où 100 % correspond à la perfection et 50 % à un résultat aléatoire. C'est mieux que le hasard, mais un test cliniquement exploitable requiert généralement une AUC de 90 % ou plus. Ce modèle n'est donc pas prêt pour un test à domicile, et encore moins pour poser un diagnostic.

Un problème technique rarement mentionné complique encore la situation : la façon dont les données microbiome sont traitées avant l'analyse influence fortement les résultats. Selon qu'un laboratoire convertit les comptages bruts en logarithmes ou travaille avec des proportions relatives, la précision calculée peut varier considérablement. Les résultats de deux laboratoires ou de deux tests différents sont ainsi difficiles à comparer, et le résultat d'un test à domicile dépend de choix techniques que le consommateur ne connaît pas et ne peut pas évaluer.

Pour le cancer du col de l'utérus, le microbiome vaginal est étudié comme biomarqueur complémentaire potentiel. Il s'agit de recherche purement exploratoire : aucun autotest validé basé sur des données microbiome n'existe encore. L'étude concernée mentionne la combinaison d'informations microbiome et de biomarqueurs protéiques comme piste de recherche intéressante, mais aucun chiffre de précision concret n'est disponible.

Dans la recherche sur la maladie d'Alzheimer, l'analyse du microbiome intestinal s'inscrit dans l'étude PREDICTOM, un programme clinique de dépistage de grande envergure. Les résultats ne sont pas encore disponibles, et l'analyse se déroule en milieu médical, pas à domicile. Par ailleurs, un protocole d'étude a été publié pour la modulation à domicile du microbiome intestinal dans le contexte du COVID-19, mais là encore aucun résultat n'est connu. Aucune de ces applications ne fournit aujourd'hui un test à domicile scientifiquement fondé. En attendant, manger suffisamment de fibres et d'aliments fermentés fait davantage pour ton microbiome qu'un test commercial.